海盜團自由編製
在遊戲中，玩家的團隊主要由戰鬥人員1名和輔助人員3名組成，並允許玩家自由選取成員來形成獨特的海盜團，記錄好自己創建的海盜團體，可以在選擇人物角色的時候隨時呼出。在團隊中，人物與人物間的組合能夠發動各種各樣的特殊技能，例如攻擊力、耐性提升等，另外，人物角色們之間還會有很多忠實於原作的互相關係而產生的特殊效果。
隊伍戰略變化系統
在玩家編輯海盜團的時候，能夠分配好輔助人物角色的「功能」來讓角色性能得到強化，而根據這個輔助角色的功能不同，整個戰鬥的戰略也會產生變化。
被分配為輔助人物的角色可以通過下屏觸摸實現最簡單的操作，例如在連續攻擊中補充攻擊、為了遠離對手等操作均可以通過不同的人物和不同的操作實現。輔助角色中，分為攻擊類型、阻礙類型等多種多樣的形式。
道具和機關
當然，只是依靠玩家自身的戰鬥技巧可以說是不可能獲得勝利的，在關卡裡面會有藏著各種各樣輔助道具的桶子，或者是大炮彈藥等等特殊物件。例如大炮彈可以扔到對手身上造成傷害，或者是其他道具令對手出現異常狀態等。有時候利用道具作戰將會有可能讓你的戰鬥一發逆轉。
通過佐羅的道具而被麻痺的路飛和綽帕
關卡機關也會在不同的關卡中登場，根據遊戲戰鬥場景的不同，各種機關也會不同，熟悉關卡地形也將會是戰鬥勝利的關鍵。
遊戲模式
冠軍賽模式
大海盜冠軍賽將會讓玩家的團隊進行增員、培養等，是遊戲中最主要的遊戲模式。
對戰模式
DS的無線連機模式能允許最多4人進行混戰，玩家可以設定2對2、連續對戰扥不同的對戰規則。戰鬥形式也可以採用得點對戰或者是生存戰形式。得點對戰只需要玩家打敗對方即可得分，最後統計得分的形式；而生存對戰則按照最後生存下來的人物角色，順序統計排名。
